26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3251 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3251  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  100 
 
 		 119 aa  236  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.79659 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5407  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  42.22 
 
 		 79 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.216203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3062  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  39.29 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1020  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  39.76 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000368524  unclonable  0.00000000295771 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0770  PemI-like protein  35.44 
 
 		 84 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1200  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  37.97 
 
 		 80 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4419  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  34.18 
 
 		 92 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.395785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1229  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  37.97 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0905  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  26.58 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000171203  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02590  hypothetical protein  26.58 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000450519  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4043  antitoxin MazE  26.58 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000354584  normal  0.435382 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3090  antitoxin MazE  26.58 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000278445  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2921  antitoxin MazE  26.58 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000204371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0929  antitoxin MazE  26.58 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000171018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3087  antitoxin MazE  26.58 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000511414  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2927  antitoxin MazE  26.58 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299538  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02628  antitoxin of the ChpA-ChpR toxin-antitoxin system  26.58 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000289943  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1098  pemI family protein  32.14 
 
 		 79 aa  47.8  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0248006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2489  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  34.52 
 
 		 89 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4870  transcriptional regulator/antitoxin MazE  33.33 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.672249  hitchhiker  0.00000150934 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4623  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  31.4 
 
 		 82 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.683129 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3377  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.36 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00170089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4160  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  36.14 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.429167 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_7280  SpoVT/AbrB-like cell growth regulatory protein  38.64 
 
 		 75 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.11675  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2540  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  34.48 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5699  transcriptional regulator/antitoxin, MazE  30.26 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.815302  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>