14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1960 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1960  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  408  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3435  ABC-type Co2+ transport system permease component-like protein  48.09 
 
 		 190 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.700435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3140  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  31.89 
 
 		 430 aa  75.9  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00188953  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3499  hypothetical protein  33.15 
 
 		 175 aa  74.3  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.128517  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1922  hypothetical protein  31.1 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1472  hypothetical protein  28.5 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2094  hypothetical protein  27.14 
 
 		 186 aa  62  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0202879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1950  hypothetical protein  31.25 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0757  hypothetical protein  25 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.321867  normal  0.794251 
 
 
-
 
NC_004310  BR1366  hypothetical protein  27.36 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1322  hypothetical protein  28.57 
 
 		 210 aa  50.8  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1191  hypothetical protein  31.77 
 
 		 215 aa  48.5  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000156419  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2143  hypothetical protein  33.33 
 
 		 110 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.987402  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0895  hypothetical protein  39.29 
 
 		 289 aa  41.6  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169761 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>