33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0544 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0544  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  667    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.520266 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0282  hypothetical protein  68.03 
 
 		 293 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.108801 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0503  hypothetical protein  70.31 
 
 		 286 aa  384  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0493  hypothetical protein  69.77 
 
 		 290 aa  384  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500337  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0547  hypothetical protein  68.77 
 
 		 296 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0653377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7547  hypothetical protein  65.1 
 
 		 258 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0407  hypothetical protein  62.13 
 
 		 289 aa  351  1e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1938  hypothetical protein  40 
 
 		 287 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.208921  normal  0.0147778 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3702  hypothetical protein  34.05 
 
 		 311 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.317768 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4907  hypothetical protein  34.15 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.904735  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4859  hypothetical protein  34.6 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4396  hypothetical protein  35.29 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.558315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4517  hypothetical protein  34.76 
 
 		 287 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0243839  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3666  hypothetical protein  34.48 
 
 		 287 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000879372 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1857  hypothetical protein  29.33 
 
 		 273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.746248 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3592  hypothetical protein  29.81 
 
 		 288 aa  132  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.456108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2555  putative signal peptide protein  28.63 
 
 		 258 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.709242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4587  hypothetical protein  30.25 
 
 		 280 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0428092  normal  0.0490486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0172  hypothetical protein  30 
 
 		 275 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4040  hypothetical protein  29.18 
 
 		 263 aa  110  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3585  hypothetical protein  29.18 
 
 		 258 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0908002 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1704  hypothetical protein  30.58 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.624159  normal  0.112956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3878  hypothetical protein  30.04 
 
 		 260 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0512827 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2291  hypothetical protein  29.57 
 
 		 259 aa  93.2  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.429146  normal  0.89015 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2639  hypothetical protein  28.57 
 
 		 292 aa  92.4  9e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0919  hypothetical protein  24.9 
 
 		 276 aa  87.4  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.40379  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3078  hypothetical protein  25.52 
 
 		 255 aa  87.8  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.186835  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2016  hypothetical protein  23.83 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.915492  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1940  hypothetical protein  23.83 
 
 		 271 aa  79.3  0.00000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0724  hypothetical protein  26.24 
 
 		 237 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.188626  normal  0.512508 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2014  hypothetical protein  26.24 
 
 		 237 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18999  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2581  hypothetical protein  23.31 
 
 		 266 aa  45.8  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132118  hitchhiker  0.00012432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3112  hypothetical protein  27.06 
 
 		 231 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.108531  hitchhiker  0.00759909 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>