44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4162 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4162  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  180  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.186646 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3873  hypothetical protein  92.39 
 
 		 92 aa  165  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0389052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4841  protein of unknown function DUF526  86.96 
 
 		 92 aa  163  8e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1414  hypothetical protein  84.44 
 
 		 88 aa  151  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0680005  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3096  hypothetical protein  89.16 
 
 		 85 aa  150  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1766  hypothetical protein  91.36 
 
 		 96 aa  147  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2505  hypothetical protein  87.8 
 
 		 85 aa  144  5e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.460066 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2263  hypothetical protein  67.09 
 
 		 109 aa  113  8.999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3020  protein of unknown function DUF526  65.06 
 
 		 86 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2757  protein of unknown function DUF526  63.86 
 
 		 86 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2251  hypothetical protein  60.92 
 
 		 96 aa  104  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.801472  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1526  hypothetical protein  56.52 
 
 		 106 aa  102  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1476  hypothetical protein  56.52 
 
 		 106 aa  102  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0240368  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1640  hypothetical protein  59.76 
 
 		 106 aa  99.4  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0853  hypothetical protein  53.93 
 
 		 107 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3170  hypothetical protein  53.93 
 
 		 91 aa  97.8  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142046  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2149  hypothetical protein  53.85 
 
 		 102 aa  97.8  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1375  protein of unknown function DUF526  48.42 
 
 		 96 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308026  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4026  protein of unknown function DUF526  48.86 
 
 		 93 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.180444  normal  0.460906 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4948  hypothetical protein  58.11 
 
 		 94 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.889907  hitchhiker  0.000000138953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2547  hypothetical protein  58.89 
 
 		 108 aa  92.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3771  hypothetical protein  48.31 
 
 		 93 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1136  protein of unknown function DUF526  56.41 
 
 		 88 aa  89  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059241 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2648  hypothetical protein  56.41 
 
 		 80 aa  87.8  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.250231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4065  protein of unknown function DUF526  47.19 
 
 		 93 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0261  hypothetical protein  56.41 
 
 		 82 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.783765 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3536  hypothetical protein  51.95 
 
 		 91 aa  85.5  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.764838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0621  hypothetical protein  55.13 
 
 		 87 aa  83.6  9e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0233  hypothetical protein  50.62 
 
 		 82 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1581  hypothetical protein  50.62 
 
 		 82 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00359975  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3332  hypothetical protein  52.56 
 
 		 79 aa  81.3  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.296234  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0993  hypothetical protein  48.72 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0435364  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2214  hypothetical protein  47.37 
 
 		 84 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.309689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2667  hypothetical protein  51.95 
 
 		 83 aa  60.1  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149229  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4470  hypothetical protein  48 
 
 		 86 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.633615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1095  protein of unknown function DUF526  40.23 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.181448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0762  hypothetical protein  37.93 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.468252 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0427  hypothetical protein  44.44 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0040  hypothetical protein  46.75 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.180106  normal  0.479768 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3160  hypothetical protein  32.14 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0552174  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0596  protein of unknown function DUF526  37.04 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.60187  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0125  hypothetical protein  32.94 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3279  hypothetical protein  40.79 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0675  hypothetical protein  32.73 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>