13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3953 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3953  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  154  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139269  normal  0.667316 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0411  hypothetical protein  60.53 
 
 		 85 aa  99.4  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1891  hypothetical protein  53.95 
 
 		 79 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.252945  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1590  hypothetical protein  49.32 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.148818  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0529  hypothetical protein  50 
 
 		 76 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.911072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2687  hypothetical protein  44.26 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383276  normal  0.520608 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1026  hypothetical protein  44.26 
 
 		 74 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2410  hypothetical protein  34.78 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2707  hypothetical protein  32.84 
 
 		 94 aa  42.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2729  hypothetical protein  32.84 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00123009  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2808  hypothetical protein  32.84 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.198035 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1657  hypothetical protein  32.84 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.681097  hitchhiker  0.000000408303 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3029  hypothetical protein  35.21 
 
 		 94 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>