29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3033 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3033  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  357  7e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2698  putative exported protein of unknown function  64.94 
 
 		 209 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0170396  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2417  hypothetical protein  79.45 
 
 		 223 aa  90.5  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.0235404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2082  hypothetical protein  73.17 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0272  hypothetical protein  90 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4232  hypothetical protein  71.79 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1942  hypothetical protein  89.66 
 
 		 128 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5051  hypothetical protein  86.21 
 
 		 134 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567981  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1022  BA14K-like  89.29 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1123  BA14K-like  85.71 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5379  BA14K family protein  71.05 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2464  hypothetical protein  55.1 
 
 		 230 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1569  hypothetical protein  65.85 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0593  hypothetical protein  77.78 
 
 		 127 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.667987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0534  hypothetical protein  58.54 
 
 		 153 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2421  BA14K family protein  75 
 
 		 141 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.92837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3811  hypothetical protein  57.5 
 
 		 124 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0228634  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2716  BA14K family protein  75 
 
 		 139 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.263756  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2493  BA14K family protein  75 
 
 		 139 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.279471 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0685  hypothetical protein  76.92 
 
 		 126 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.504453  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2373  hypothetical protein  66.67 
 
 		 137 aa  48.5  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00903594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3174  hypothetical protein  72 
 
 		 135 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.798003  normal  0.0785982 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2137  hypothetical protein  72 
 
 		 129 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.150789  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3358  BA14K family protein  62.96 
 
 		 147 aa  47  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.976069 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2722  hypothetical protein  54.84 
 
 		 129 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.585488  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2136  hypothetical protein  68 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129106  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3014  hypothetical protein  51.52 
 
 		 133 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12196  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3004  BA14K family protein  37.5 
 
 		 150 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2744  hypothetical protein  45.45 
 
 		 155 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>