23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3014 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3014  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  255  1e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12196  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2438  hypothetical protein  74.44 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2722  hypothetical protein  58.65 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.585488  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1123  BA14K-like  57.38 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1942  hypothetical protein  43.59 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0272  hypothetical protein  48.98 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5051  hypothetical protein  58.06 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567981  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1022  BA14K-like  51.61 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4232  hypothetical protein  62.96 
 
 		 235 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0593  hypothetical protein  59.26 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.667987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2716  BA14K family protein  41.82 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.263756  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2493  BA14K family protein  41.82 
 
 		 139 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.279471 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5379  BA14K family protein  51.61 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2421  BA14K family protein  41.82 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.92837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2698  putative exported protein of unknown function  59.26 
 
 		 209 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0170396  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2082  hypothetical protein  45.16 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2239  hypothetical protein  65.38 
 
 		 138 aa  42  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3033  hypothetical protein  51.52 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3004  BA14K family protein  65.38 
 
 		 150 aa  42  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0685  hypothetical protein  57.69 
 
 		 126 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.504453  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2744  hypothetical protein  65.38 
 
 		 155 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3174  hypothetical protein  64 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.798003  normal  0.0785982 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1649  hypothetical protein  48.84 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.989787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>