18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2644 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2644  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  153  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.105461 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2359  hypothetical protein  77.5 
 
 		 81 aa  124  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.51473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4244  hypothetical protein  79.22 
 
 		 78 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3013  hypothetical protein  87.5 
 
 		 80 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0272  hypothetical protein  68.75 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3615  hypothetical protein  68.49 
 
 		 84 aa  97.8  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1473  hypothetical protein  53.42 
 
 		 77 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.375444  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4172  hypothetical protein  52.86 
 
 		 77 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2772  hypothetical protein  57.14 
 
 		 80 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.116044  normal  0.0824549 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2875  hypothetical protein  54.29 
 
 		 80 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.814143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2648  hypothetical protein  52.86 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.242047 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3430  hypothetical protein  50 
 
 		 288 aa  57.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.700261 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2393  hypothetical protein  50.7 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121974  decreased coverage  0.0016058 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2150  hypothetical protein  49.3 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.147337 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1470  hypothetical protein  45 
 
 		 78 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.195089 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0571  hypothetical protein  51.16 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4147  hypothetical protein  41.79 
 
 		 74 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2631  hypothetical protein  37.88 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>