17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1527 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1527  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  618  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2468  hypothetical protein  33.67 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3219  hypothetical protein  31.61 
 
 		 322 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1318  hypothetical protein  30.61 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.575066  hitchhiker  0.000000517485 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1480  hypothetical protein  30.81 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213383  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0597  hypothetical protein  29.38 
 
 		 218 aa  68.6  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2761  hypothetical protein  28.65 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2907  hypothetical protein  28.65 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36844  predicted protein  24.58 
 
 		 382 aa  58.5  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4288  hypothetical protein  28.34 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1366  TPR repeat-containing protein  27.47 
 
 		 402 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104941  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1531  hypothetical protein  28.31 
 
 		 265 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.842491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2046  hypothetical protein  26.34 
 
 		 257 aa  48.9  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.15378  hitchhiker  0.00220889 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4841  hypothetical protein  29.31 
 
 		 268 aa  44.3  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.781008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1603  methyltransferase  25.57 
 
 		 250 aa  43.5  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0961948  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5642  hypothetical protein  27.35 
 
 		 316 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2516  methyltransferase  27.46 
 
 		 230 aa  42.4  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.524649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>