48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4848 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4848  SdiA-regulated  100 
 
 		 317 aa  640    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5290  hypothetical protein  86.38 
 
 		 312 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.842454  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5383  SdiA-regulated  63.7 
 
 		 305 aa  378  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.02449 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0314  SdiA-regulated domain-containing protein  61.26 
 
 		 303 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183725 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5204  SdiA-regulated domain-containing protein  61 
 
 		 300 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5151  SdiA-regulated domain protein  64.03 
 
 		 300 aa  361  8e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.965879  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5058  SdiA-regulated domain-containing protein  64.03 
 
 		 300 aa  361  8e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0993064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04270  putative transcriptional regulator  59.93 
 
 		 321 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.510674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0418  hypothetical protein  59.93 
 
 		 321 aa  334  1e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4227  SdiA-regulated domain-containing protein  53.31 
 
 		 303 aa  311  9e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22840  SdiA-regulated domain-containing protein  56.52 
 
 		 308 aa  308  5e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0239521  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3272  SdiA-regulated protein  54.3 
 
 		 325 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38420  hypothetical protein  51.43 
 
 		 309 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224716 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4229  SdiA-regulated domain-containing protein  44.4 
 
 		 317 aa  211  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0412  putatitve transcriptional regulator  40.94 
 
 		 310 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04160  putatitve transcriptional regulator  42.69 
 
 		 329 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5589  hypothetical protein  37.05 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5291  hypothetical protein  40.71 
 
 		 310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48290  hypothetical protein  36.89 
 
 		 305 aa  179  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4849  SdiA-regulated  37.92 
 
 		 314 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07110  hypothetical protein  38.43 
 
 		 317 aa  179  5.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187526  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0313  SdiA-regulated domain-containing protein  40.39 
 
 		 306 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.124016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5384  SdiA-regulated  37.98 
 
 		 307 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5205  SdiA-regulated domain-containing protein  38.74 
 
 		 305 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.520929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5059  SdiA-regulated domain-containing protein  38.82 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5152  SdiA-regulated domain protein  38.82 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.767361 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5110  SdiA-regulated  35.4 
 
 		 326 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4933  hypothetical protein  30.51 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4878  SdiA-regulated protein  30.54 
 
 		 329 aa  153  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.60346 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5845  SdiA-regulated protein  30.54 
 
 		 280 aa  151  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.539509 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04202  hypothetical protein  30.48 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04165  hypothetical protein  30.48 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00151161  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3731  SdiA-regulated domain-containing protein  30.48 
 
 		 286 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00663861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4561  hypothetical protein  29.13 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3663  SdiA-regulated domain protein  30.48 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000154748  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4772  conserved hypothetical protein yjiK  28.8 
 
 		 323 aa  146  5e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4658  hypothetical protein  34.9 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4566  hypothetical protein  34.9 
 
 		 301 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.859711  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4657  hypothetical protein  34.51 
 
 		 301 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4573  sdiA-regulated family protein  34.51 
 
 		 286 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4706  SdiA-regulated family protein  34.51 
 
 		 286 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4588  SrgB  38.1 
 
 		 282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.537966  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0044  SrgB  38.1 
 
 		 282 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.880775 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4679  hypothetical protein  37.3 
 
 		 282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5082  sdiA-regulated domain protein  30 
 
 		 272 aa  99  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.142061 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2428  hypothetical protein  27.13 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0451472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1385  putative extracellular nuclease  25.1 
 
 		 751 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14292  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1215  inner membrane protein  22.18 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>