17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1854 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_1854  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  370  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.988982 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2143  YgfB and YecA  97.3 
 
 		 185 aa  360  6e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2181  hypothetical protein  53.23 
 
 		 183 aa  192  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3889  hypothetical protein  37.28 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.370714  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45840  hypothetical protein  36.69 
 
 		 195 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1467  YgfB and YecA  35.09 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3806  yecA family protein  33.92 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  hitchhiker  0.00000393308 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4023  yecA family protein  33.92 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158141 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4517  hypothetical protein  33.33 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.301076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1394  yecA family protein  33.33 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1811  yecA family protein  35.12 
 
 		 195 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1643  hypothetical protein  33.33 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3739  hypothetical protein  32.18 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.144928  normal  0.012413 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1877  yecA family protein  32.16 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0863  YgfB and YecA  26.9 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_32810  metal-binding protein  33.14 
 
 		 195 aa  52  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.225261  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_2227  yecA family protein  30.18 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.802171  normal  1 
 
 
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