48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_5058 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5151  SdiA-regulated domain protein  99.33 
 
 		 300 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.965879  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5058  SdiA-regulated domain-containing protein  100 
 
 		 300 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0993064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5204  SdiA-regulated domain-containing protein  96 
 
 		 300 aa  584  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0314  SdiA-regulated domain-containing protein  88.78 
 
 		 303 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183725 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5383  SdiA-regulated  72.28 
 
 		 305 aa  449  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.02449 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04270  putative transcriptional regulator  70 
 
 		 321 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.510674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0418  hypothetical protein  69.64 
 
 		 321 aa  400  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4848  SdiA-regulated  64.03 
 
 		 317 aa  361  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22840  SdiA-regulated domain-containing protein  63.8 
 
 		 308 aa  357  9.999999999999999e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0239521  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4227  SdiA-regulated domain-containing protein  59.27 
 
 		 303 aa  353  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5290  hypothetical protein  61.4 
 
 		 312 aa  352  5e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.842454  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3272  SdiA-regulated protein  50.89 
 
 		 325 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38420  hypothetical protein  49.82 
 
 		 309 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224716 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4229  SdiA-regulated domain-containing protein  44.3 
 
 		 317 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04160  putatitve transcriptional regulator  42.32 
 
 		 329 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0412  putatitve transcriptional regulator  42.01 
 
 		 310 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5291  hypothetical protein  42.58 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4849  SdiA-regulated  42.52 
 
 		 314 aa  192  5e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48290  hypothetical protein  42.65 
 
 		 305 aa  192  6e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5205  SdiA-regulated domain-containing protein  41.18 
 
 		 305 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.520929  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5589  hypothetical protein  39.07 
 
 		 326 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07110  hypothetical protein  42.31 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187526  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0313  SdiA-regulated domain-containing protein  41.18 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.124016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5152  SdiA-regulated domain protein  40.78 
 
 		 306 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.767361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5059  SdiA-regulated domain-containing protein  40.39 
 
 		 306 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5384  SdiA-regulated  39.3 
 
 		 307 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5110  SdiA-regulated  37.09 
 
 		 326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5845  SdiA-regulated protein  32.7 
 
 		 280 aa  161  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.539509 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4933  hypothetical protein  30.63 
 
 		 323 aa  159  5e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4878  SdiA-regulated protein  32.32 
 
 		 329 aa  158  8e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.60346 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4561  hypothetical protein  31 
 
 		 323 aa  158  9e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3731  SdiA-regulated domain-containing protein  31 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00663861  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04202  hypothetical protein  30.63 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04165  hypothetical protein  30.63 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00151161  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3663  SdiA-regulated domain protein  30.63 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000154748  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4772  conserved hypothetical protein yjiK  30.63 
 
 		 323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4566  hypothetical protein  33.33 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.859711  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4658  hypothetical protein  33.33 
 
 		 301 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4573  sdiA-regulated family protein  33.98 
 
 		 286 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4706  SdiA-regulated family protein  33.98 
 
 		 286 aa  149  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4657  hypothetical protein  32.95 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4588  SrgB  34 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.537966  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0044  SrgB  34 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.880775 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4679  hypothetical protein  33.67 
 
 		 282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2428  hypothetical protein  31.78 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0451472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5082  sdiA-regulated domain protein  30.93 
 
 		 272 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.142061 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1385  putative extracellular nuclease  23.23 
 
 		 751 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14292  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1215  inner membrane protein  24.54 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>