14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4933 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5060  hypothetical protein  96.27 
 
 		 1571 aa  3021    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4933  hypothetical protein  100 
 
 		 1530 aa  3125    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0405  hypothetical protein  33.7 
 
 		 1555 aa  725    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.354945 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5111  hypothetical protein  31.11 
 
 		 1559 aa  626  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4883  hypothetical protein  27.24 
 
 		 1586 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.718638 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5009  hypothetical protein  27.3 
 
 		 1586 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5059  hypothetical protein  30.51 
 
 		 1565 aa  400  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3453  hypothetical protein  24.69 
 
 		 1527 aa  151  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3707  hypothetical protein  22.93 
 
 		 1743 aa  77.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1768  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1742 aa  69.3  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0539  hypothetical protein  24.73 
 
 		 859 aa  57  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0348  hypothetical protein  23.52 
 
 		 928 aa  46.6  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.451074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0266  hypothetical protein  41.89 
 
 		 1830 aa  46.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.639279  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5119  hypothetical protein  25.13 
 
 		 1076 aa  45.1  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>