34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2940 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2940  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  240  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1975  hypothetical protein  75.24 
 
 		 106 aa  154  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.793487  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3322  hypothetical protein  71.56 
 
 		 111 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.840275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3015  hypothetical protein  43.93 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4507  hypothetical protein  50.55 
 
 		 112 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59860  putative type III effector Hop protein  50 
 
 		 119 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114799  hitchhiker  0.000000000000152109 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2194  hypothetical protein  46.32 
 
 		 119 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1634  hypothetical protein  44.55 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4171  hypothetical protein  48.39 
 
 		 127 aa  73.9  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0787775  normal  0.908625 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1450  hypothetical protein  39.39 
 
 		 120 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176876 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3416  hypothetical protein  44.71 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.199537  normal  0.0728248 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0869  hypothetical protein  41.58 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1192  hypothetical protein  47.62 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0476297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1406  putative secreted protein  48.81 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0449246  normal  0.883784 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36200  Plasmid hypothetical protein, RAQPRD  44.44 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0956  hypothetical protein  50 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1264  hypothetical protein  46.32 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2345  hypothetical protein  46.43 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000024781  unclonable  0.000000135076 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0443  hypothetical protein  38.18 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0652  hypothetical protein  40.62 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1172  plasmid conserved hypothetical protein RAQPRD  45.24 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2386  hypothetical protein  45.57 
 
 		 115 aa  65.5  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0675  hypothetical protein  45.21 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4094  hypothetical protein  44.58 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4177  hypothetical protein  44.58 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0329  hypothetical protein  41.05 
 
 		 110 aa  62  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.132936 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3713  hypothetical protein  43.04 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2851  plasmid conserved hypothetical protein RAQPRD  41.46 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.410832  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0368  hypothetical protein  55.32 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0640  hypothetical protein  36.26 
 
 		 100 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1756  hypothetical protein  34.07 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0510  hypothetical protein  30.58 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0682  hypothetical protein  32.97 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2762  hypothetical protein  25.47 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>