19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2516 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2516  carotene hydroxylase  100 
 
 		 155 aa  311  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3246  beta-carotene hydroxylase  99.35 
 
 		 155 aa  309  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2665  fatty acid hydroxylase  85.16 
 
 		 155 aa  276  8e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2647  fatty acid hydroxylase  92.21 
 
 		 176 aa  268  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.810487  normal  0.467325 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4535  carotene hydroxylase  53.33 
 
 		 168 aa  149  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.179173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1168  carotene hydroxylase  48.73 
 
 		 176 aa  137  7e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5702  fatty acid hydroxylase  40.76 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733403 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2128  carotene hydroxylase  45.22 
 
 		 200 aa  123  8.000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.287054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1710  fatty acid hydroxylase  44.9 
 
 		 157 aa  120  7e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0174617  normal  0.199306 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2033  fatty acid hydroxylase  38.26 
 
 		 158 aa  99  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0059  carotene hydroxylase  33.57 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5618  fatty acid hydroxylase  35.81 
 
 		 158 aa  89.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2089  fatty acid hydroxylase  34.21 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.213926  normal  0.0390398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2038  beta-carotene hydroxylase  31.08 
 
 		 155 aa  86.3  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0223903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0482  fatty acid hydroxylase  38.52 
 
 		 153 aa  75.9  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0702  fatty acid hydroxylase  31.97 
 
 		 151 aa  70.9  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00925  beta carotene hydroxylase  31.69 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1074  carotene hydroxylase  30.94 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_9013  predicted protein  34.38 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0252602  normal  0.0220603 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>