21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1983 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1983  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  196  9e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490297 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1096  hypothetical protein  87.88 
 
 		 100 aa  175  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4937  hypothetical protein  84 
 
 		 100 aa  171  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0942903  normal  0.32552 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1746  hypothetical protein  82 
 
 		 100 aa  167  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0623584  normal  0.256502 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2300  hypothetical protein  75.76 
 
 		 103 aa  152  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1052  hypothetical protein  70.71 
 
 		 99 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00452566  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0915  hypothetical protein  73 
 
 		 100 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4025  hypothetical protein  62.63 
 
 		 99 aa  122  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.373255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1179  hypothetical protein  67 
 
 		 100 aa  120  6e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.933496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0965  hypothetical protein  65.31 
 
 		 101 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00474357 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5651  hypothetical protein  66 
 
 		 100 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5400  hypothetical protein  54.64 
 
 		 102 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4717  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  52 
 
 		 101 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.649718 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1383  hypothetical protein  38.78 
 
 		 121 aa  84.7  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3597  hypothetical protein  45.26 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0220403  normal  0.150744 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0229  hypothetical protein  45.26 
 
 		 103 aa  82  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00650925  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4409  hypothetical protein  44.21 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.5782  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1950  hypothetical protein  37.25 
 
 		 219 aa  70.1  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1939  hypothetical protein  41.46 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4010  hypothetical protein  35.29 
 
 		 239 aa  63.9  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.927237  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  29.79 
 
 		 102 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>