19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2665 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2665  fatty acid hydroxylase  100 
 
 		 155 aa  310  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3246  beta-carotene hydroxylase  85.16 
 
 		 155 aa  256  1e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2516  carotene hydroxylase  85.16 
 
 		 155 aa  255  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2647  fatty acid hydroxylase  83.77 
 
 		 176 aa  245  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.810487  normal  0.467325 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4535  carotene hydroxylase  54 
 
 		 168 aa  151  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.179173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1168  carotene hydroxylase  48.1 
 
 		 176 aa  133  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2128  carotene hydroxylase  47.06 
 
 		 200 aa  125  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.287054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5702  fatty acid hydroxylase  40.13 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733403 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1710  fatty acid hydroxylase  42.95 
 
 		 157 aa  116  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0174617  normal  0.199306 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2033  fatty acid hydroxylase  36.6 
 
 		 158 aa  97.8  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0059  carotene hydroxylase  33.57 
 
 		 146 aa  94.7  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2089  fatty acid hydroxylase  33.33 
 
 		 152 aa  90.9  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.213926  normal  0.0390398 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5618  fatty acid hydroxylase  35.21 
 
 		 158 aa  87  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2038  beta-carotene hydroxylase  31.34 
 
 		 155 aa  83.6  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0223903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0482  fatty acid hydroxylase  40.16 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0702  fatty acid hydroxylase  34.48 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1074  carotene hydroxylase  31.17 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00925  beta carotene hydroxylase  28.86 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_9013  predicted protein  35.42 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0252602  normal  0.0220603 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>