19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4544 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4544  colicin immunity protein/pyocin immunity protein  100 
 
 		 85 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00542  hypothetical protein  37.35 
 
 		 85 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0117  putative colicin immunity protein  30.77 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.301889 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3287  colicin-E7 immunity protein  32.22 
 
 		 92 aa  56.6  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.918498  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0121  putative colicin immunity protein  32.63 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.974645  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0119  putative colicin immunity protein  29.79 
 
 		 96 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.385833 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4047  colicin immunity protein/pyocin immunity protein  30.95 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0165  colicin/pyocin immunity family protein  37.04 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0497  colicin-E7 immunity protein  30.95 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.127855  hitchhiker  0.00059391 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4762  colicin immunity protein/pyocin immunity protein  36.14 
 
 		 84 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534582 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5396  colicin immunity protein/pyocin immunity protein  36.25 
 
 		 85 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576115  hitchhiker  0.00133888 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5233  colicin/pyocin immunity family protein  31.03 
 
 		 90 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5377  S-type pyocin domain-containing protein  28.89 
 
 		 505 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496303 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0309  colicin immunity protein/pyocin immunity protein  28.74 
 
 		 90 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2843  Colicin immunity protein/pyocin immunity protein  31.91 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00118545  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4760  colicin immunity protein/pyocin immunity protein  26.51 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4652  colicin immunity protein/pyocin immunity protein  24.72 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4420  colicin immunity protein/pyocin immunity protein  28.24 
 
 		 87 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1305  Pyocin S-type immunity protein, putative  28.24 
 
 		 87 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>