12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4079 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4079  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  316  9e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.741455  normal  0.460456 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1322  hypothetical protein  92.76 
 
 		 152 aa  268  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4567  hypothetical protein  92.76 
 
 		 171 aa  266  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3868  hypothetical protein  72.19 
 
 		 156 aa  201  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1334  hypothetical protein  32.89 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1555  hypothetical protein  33.79 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6728  hypothetical protein  30.99 
 
 		 172 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00401956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2478  hypothetical protein  28.37 
 
 		 294 aa  54.3  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.545885  normal  0.0244888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6195  hypothetical protein  29.73 
 
 		 168 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1377  hypothetical protein  28.57 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.600318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1365  hypothetical protein  25.68 
 
 		 158 aa  40.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.13629  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1462  hypothetical protein  25 
 
 		 158 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>