188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3107 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3107  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  643    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2687  hypothetical protein  96.52 
 
 		 316 aa  628  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0355776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3066  hypothetical protein  96.52 
 
 		 316 aa  627  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.417228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3012  hypothetical protein  94.94 
 
 		 316 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.256372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2596  hypothetical protein  77.78 
 
 		 316 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0574332  normal  0.403817 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1736  hypothetical protein  75.48 
 
 		 316 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2060  hypothetical protein  73.5 
 
 		 319 aa  475  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.352485  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1870  hypothetical protein  73.19 
 
 		 319 aa  472  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.088676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37680  hypothetical protein  71.11 
 
 		 316 aa  464  9.999999999999999e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.454306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42150  hypothetical protein  71.43 
 
 		 317 aa  441  1e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3575  hypothetical protein  70.25 
 
 		 318 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0392  hypothetical protein  47.45 
 
 		 322 aa  301  1e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0363  hypothetical protein  46.52 
 
 		 309 aa  294  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3875  protein of unknown function DUF403  46.52 
 
 		 315 aa  289  4e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0539  hypothetical protein  44.9 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3575  protein of unknown function DUF403  44.3 
 
 		 309 aa  277  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.624833  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5078  hypothetical protein  46.44 
 
 		 322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605764 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3402  protein of unknown function DUF403  44.97 
 
 		 318 aa  272  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.454494  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1311  protein of unknown function DUF403  44.13 
 
 		 333 aa  272  6e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.754495  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0965  protein of unknown function DUF403  44.09 
 
 		 316 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0328086 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1061  protein of unknown function DUF403  44.09 
 
 		 316 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.823298  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1122  hypothetical protein  43.13 
 
 		 316 aa  269  4e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.225451  normal  0.376208 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2473  hypothetical protein  44.79 
 
 		 319 aa  267  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.353765  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0405  hypothetical protein  45.14 
 
 		 319 aa  266  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.171087 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0070  hypothetical protein  44.41 
 
 		 308 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0505568  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1354  hypothetical protein  46.15 
 
 		 324 aa  266  4e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.531652  hitchhiker  0.00962099 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2549  hypothetical protein  43.61 
 
 		 318 aa  264  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0459959  normal  0.464961 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3020  hypothetical protein  43.85 
 
 		 315 aa  263  4e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00142607  normal  0.658817 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1084  hypothetical protein  41.53 
 
 		 317 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1048  hypothetical protein  42.49 
 
 		 317 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0181882  normal  0.326786 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0936  protein of unknown function DUF403  44.69 
 
 		 322 aa  261  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1021  hypothetical protein  44.69 
 
 		 322 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.434907  normal  0.790482 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3389  hypothetical protein  44.97 
 
 		 345 aa  255  8e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2606  hypothetical protein  42.99 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4444  protein of unknown function DUF403  43.99 
 
 		 316 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1207  hypothetical protein  41.74 
 
 		 320 aa  250  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.133906 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3156  hypothetical protein  43.79 
 
 		 320 aa  249  4e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.144051  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4512  hypothetical protein  43.53 
 
 		 316 aa  245  8e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0764  hypothetical protein  42.41 
 
 		 316 aa  243  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1428  hypothetical protein  37.58 
 
 		 325 aa  243  3e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1941  hypothetical protein  40 
 
 		 313 aa  242  7.999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572678 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2165  protein of unknown function DUF403  40.06 
 
 		 314 aa  230  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3539  hypothetical protein  40.88 
 
 		 316 aa  228  8e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0583  hypothetical protein  38.49 
 
 		 315 aa  226  6e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.884182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2485  protein of unknown function DUF403  39.75 
 
 		 314 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.721893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2209  hypothetical protein  39.75 
 
 		 314 aa  218  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7511  protein of unknown function DUF403  38.1 
 
 		 314 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0621482  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2470  protein of unknown function DUF403  37.66 
 
 		 314 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549265  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3051  hypothetical protein  37.19 
 
 		 319 aa  210  3e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2300  protein of unknown function DUF403  37.07 
 
 		 319 aa  210  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0330793 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5274  hypothetical protein  36.16 
 
 		 314 aa  209  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.165267 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3217  hypothetical protein  36.39 
 
 		 314 aa  205  8e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6764  hypothetical protein  37.78 
 
 		 314 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.360526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2239  hypothetical protein  36.08 
 
 		 314 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.580599  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1079  hypothetical protein  36.71 
 
 		 316 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3158  hypothetical protein  35.53 
 
 		 314 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.188108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1566  hypothetical protein  36.39 
 
 		 316 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.281936  normal  0.177657 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3436  hypothetical protein  34.71 
 
 		 321 aa  199  6e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2416  hypothetical protein  36.39 
 
 		 316 aa  199  7e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0007  hypothetical protein  35.56 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.441698 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2902  protein of unknown function DUF403  34.39 
 
 		 313 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0224401  normal  0.852232 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4481  hypothetical protein  35.67 
 
 		 313 aa  190  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3167  protein of unknown function DUF403  34.39 
 
 		 313 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.78656  normal  0.654183 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3525  hypothetical protein  33.44 
 
 		 313 aa  189  7e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1492  protein of unknown function DUF403  33.33 
 
 		 335 aa  187  2e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0309521  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0396  protein of unknown function DUF403  33.44 
 
 		 320 aa  186  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.995526 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3243  protein of unknown function DUF403  33.65 
 
 		 313 aa  186  5e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.622623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3520  hypothetical protein  32.8 
 
 		 313 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1033  hypothetical protein  33.75 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.403724 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4003  hypothetical protein  32.48 
 
 		 313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0922511  normal  0.156692 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1935  hypothetical protein  32.8 
 
 		 313 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1814  hypothetical protein  35.13 
 
 		 313 aa  181  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0331912  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4494  protein of unknown function DUF403  33.65 
 
 		 321 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1743  hypothetical protein  32.5 
 
 		 356 aa  179  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.331715  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3414  hypothetical protein  32.17 
 
 		 313 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.217438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4257  hypothetical protein  32.17 
 
 		 313 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591359  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4109  hypothetical protein  32.17 
 
 		 313 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00537725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4430  protein of unknown function DUF403  33.65 
 
 		 321 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1780  hypothetical protein  31.53 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2053  hypothetical protein  31.53 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4108  hypothetical protein  32.17 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0772  hypothetical protein  31.53 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.715045  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1065  hypothetical protein  31.53 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0766  hypothetical protein  31.53 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0675  hypothetical protein  31.53 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2040  hypothetical protein  31.53 
 
 		 313 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0798659  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1921  hypothetical protein  31.53 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4767  protein of unknown function DUF403  31.87 
 
 		 329 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2677  hypothetical protein  33.02 
 
 		 313 aa  176  6e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.174455  normal  0.967196 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3593  protein of unknown function DUF403  32.6 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0544052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0824  hypothetical protein  35.29 
 
 		 319 aa  174  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.695659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1750  protein of unknown function DUF403  30.96 
 
 		 357 aa  169  5e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.594588  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1402  hypothetical protein  31.56 
 
 		 360 aa  168  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.236553 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1184  hypothetical protein  30.63 
 
 		 357 aa  167  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.965632  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0520  hypothetical protein  34.71 
 
 		 311 aa  166  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.582097  normal  0.757223 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4414  protein of unknown function DUF403  30.22 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2774  hypothetical protein  32.38 
 
 		 315 aa  162  7e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0732  protein of unknown function DUF403  31.37 
 
 		 355 aa  160  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1064  protein of unknown function DUF403  30 
 
 		 354 aa  159  5e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1050  hypothetical protein  31.56 
 
 		 313 aa  159  7e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>