19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2647 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2647  fatty acid hydroxylase  100 
 
 		 176 aa  359  1e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.810487  normal  0.467325 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3246  beta-carotene hydroxylase  92.86 
 
 		 155 aa  269  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2516  carotene hydroxylase  92.21 
 
 		 155 aa  268  4e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2665  fatty acid hydroxylase  83.77 
 
 		 155 aa  267  5e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4535  carotene hydroxylase  52.32 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.179173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1168  carotene hydroxylase  46.41 
 
 		 176 aa  125  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2128  carotene hydroxylase  39.66 
 
 		 200 aa  124  7e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.287054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1710  fatty acid hydroxylase  44.52 
 
 		 157 aa  121  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0174617  normal  0.199306 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5702  fatty acid hydroxylase  38.85 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733403 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2033  fatty acid hydroxylase  39.13 
 
 		 158 aa  97.1  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0059  carotene hydroxylase  33.57 
 
 		 146 aa  93.2  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2089  fatty acid hydroxylase  36.96 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.213926  normal  0.0390398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2038  beta-carotene hydroxylase  33.33 
 
 		 155 aa  86.7  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0223903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5618  fatty acid hydroxylase  34.93 
 
 		 158 aa  84.7  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0482  fatty acid hydroxylase  39.29 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0702  fatty acid hydroxylase  33.58 
 
 		 151 aa  72  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1074  carotene hydroxylase  30.97 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00925  beta carotene hydroxylase  31.91 
 
 		 150 aa  60.5  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_9013  predicted protein  35.42 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0252602  normal  0.0220603 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>