11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0855 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0818  hypothetical protein  87.7 
 
 		 411 aa  693    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.4746 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0841  hypothetical protein  87.97 
 
 		 375 aa  699    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140514  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0855  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  785    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0272  hypothetical protein  59.04 
 
 		 375 aa  455  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.298868 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3626  hypothetical protein  39.82 
 
 		 576 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00173227  normal  0.0443221 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3085  hypothetical protein  29.95 
 
 		 757 aa  65.1  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.105752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4120  hypothetical protein  29.38 
 
 		 399 aa  63.9  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29772  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2487  hypothetical protein  31.78 
 
 		 753 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2345  hypothetical protein  31.78 
 
 		 753 aa  46.2  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1840  hypothetical protein  30.89 
 
 		 1084 aa  43.1  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2056  hypothetical protein  31.33 
 
 		 1027 aa  43.1  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>