13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2755 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2755  exoV domain-containing protein  100 
 
 
271 aa  547  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26470  ExoV-like protein  37.95 
 
 
268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2361  exoV domain-containing protein  31.36 
 
 
266 aa  104  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.042904 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07240  xanthan biosynthesis pyruvyltransferase GumL  27.88 
 
 
269 aa  89.4  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0789  hypothetical protein  29.17 
 
 
296 aa  83.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4932  hypothetical protein  29.84 
 
 
625 aa  72.8  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01402  exopolysaccharide xanthan biosynthesis pyruvyltransferase GumL  26.49 
 
 
264 aa  59.3  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4913  ExoV-like protein  31.34 
 
 
285 aa  58.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3832  succinoglycan biosynthesis ketolase  25.64 
 
 
304 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4804  ExoV-like protein  25.45 
 
 
333 aa  57.4  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1100  xanthan biosynthesis pyruvyltransferase GumL  27.39 
 
 
274 aa  52  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4937  hypothetical protein  24.76 
 
 
696 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47160  predicted protein  28.44 
 
 
390 aa  43.5  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000445115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>