21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1233 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1233  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  224  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.921092  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3672  hypothetical protein  86.61 
 
 
112 aa  203  5e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0775  hypothetical protein  84.82 
 
 
112 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2339  hypothetical protein  57.94 
 
 
112 aa  133  8e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2259  hypothetical protein  43.24 
 
 
119 aa  105  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000118561  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1158  hypothetical protein  46.81 
 
 
111 aa  101  3e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0041  hypothetical protein  45.26 
 
 
113 aa  89.7  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00636964  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0800  hypothetical protein  43 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1556  hypothetical protein  39.42 
 
 
108 aa  76.6  0.00000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2683  hypothetical protein  34.74 
 
 
109 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.828322  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1081  hypothetical protein  32.17 
 
 
115 aa  60.8  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00650626  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39620  hypothetical protein  30.19 
 
 
108 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.8273 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3361  hypothetical protein  30.19 
 
 
112 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00221996  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2654  hypothetical protein  33.68 
 
 
111 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4503  Protein of unknown function DUF2149  29.63 
 
 
120 aa  46.2  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426307  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0179  hypothetical protein  35.29 
 
 
111 aa  45.4  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0424418  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1724  Protein of unknown function DUF2149  26.21 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.125072  normal  0.449208 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0753  hypothetical protein  36.19 
 
 
112 aa  42  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1478  hypothetical protein  35.24 
 
 
112 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1201  hypothetical protein  35.24 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.240997  normal  0.738905 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27460  hypothetical protein  26.17 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0416208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>