12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1104 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1104  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  293  6e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000403669  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0568  hypothetical protein  46.88 
 
 
133 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0168206  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0290  hypothetical protein  43.33 
 
 
130 aa  103  8e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0022  hypothetical protein  36.92 
 
 
139 aa  90.5  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0432  hypothetical protein  37.82 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0682  hypothetical protein  40 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.798662  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3072  hypothetical protein  31.9 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.283945  normal  0.874986 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3050  hypothetical protein  31.9 
 
 
127 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2727  hypothetical protein  31.45 
 
 
133 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1877  hypothetical protein  34.11 
 
 
134 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1628  hypothetical protein  27.64 
 
 
128 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1202  hypothetical protein  28.85 
 
 
139 aa  40  0.01  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000142447  hitchhiker  0.00000387981 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>