14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0682 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0682  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  256  5.0000000000000005e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.798662  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0290  hypothetical protein  49.18 
 
 
130 aa  101  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0568  hypothetical protein  50 
 
 
133 aa  92.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0168206  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1104  hypothetical protein  38.71 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000403669  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0022  hypothetical protein  35.29 
 
 
139 aa  79.3  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1877  hypothetical protein  45.52 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1202  hypothetical protein  40.19 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000142447  hitchhiker  0.00000387981 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3050  hypothetical protein  34.15 
 
 
127 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3072  hypothetical protein  33.61 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.283945  normal  0.874986 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1608  hypothetical protein  39.42 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.125339  normal  0.6223 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2727  hypothetical protein  28.93 
 
 
133 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0432  hypothetical protein  33.63 
 
 
156 aa  54.3  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1628  hypothetical protein  33.07 
 
 
128 aa  50.4  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0445  hypothetical protein  34.38 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>