16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2007 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0872  hypothetical protein  69.62 
 
 		 456 aa  666    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0833922  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2007  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  934    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1894  hypothetical protein  25.25 
 
 		 440 aa  96.7  9e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.999283  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1452  hypothetical protein  23.61 
 
 		 441 aa  92  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0150182  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0697  hypothetical protein  23.53 
 
 		 468 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4870  hypothetical protein  23.1 
 
 		 451 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1810  hypothetical protein  21.81 
 
 		 441 aa  79.7  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3924  hypothetical protein  23.09 
 
 		 438 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.647872  hitchhiker  0.00979003 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1840  hypothetical protein  22.42 
 
 		 443 aa  73.6  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.835777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2105  hypothetical protein  21.7 
 
 		 434 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.843241  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3997  hypothetical protein  23 
 
 		 441 aa  70.5  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.200317  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3770  hypothetical protein  21.74 
 
 		 455 aa  70.1  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00806133 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1557  hypothetical protein  22.34 
 
 		 450 aa  69.3  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.283773 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0417  AAA ATPase  22.5 
 
 		 433 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3933  hypothetical protein  20.53 
 
 		 479 aa  60.5  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.218593  unclonable  0.0000403133 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2892  hypothetical protein  20.66 
 
 		 443 aa  60.1  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000583528 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>