12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1256 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1256    100 
 
 		 509 bp  1009    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1046    89.57 
 
 		 1064 bp  133  5.0000000000000004e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.668578  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2189  hypothetical protein  88.29 
 
 		 1062 bp  117  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1243  hypothetical protein  88.29 
 
 		 1062 bp  117  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.568171  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0354  hypothetical protein  86.49 
 
 		 1059 bp  101  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1073    87.13 
 
 		 489 bp  97.6  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000428725  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0293  putative cytoplasmic protein  83.33 
 
 		 1086 bp  83.8  0.00000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2497  hypothetical protein  85.71 
 
 		 1056 bp  83.8  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0074171  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52340  cytoplasmic protein  84.69 
 
 		 1074 bp  75.8  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0640  hypothetical protein  90.57 
 
 		 1059 bp  65.9  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.914788  normal  0.827759 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1340  virulence protein  96.67 
 
 		 1005 bp  52  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0428  hypothetical protein  89.74 
 
 		 1023 bp  46.1  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>