14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0971 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0971  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2546  hypothetical protein  90.94 
 
 		 277 aa  523  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3122  hypothetical protein  56.52 
 
 		 284 aa  333  2e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2345  hypothetical protein  54.51 
 
 		 282 aa  325  5e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.129734  normal  0.0203272 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1402  hypothetical protein  38.35 
 
 		 307 aa  203  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.201679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0680  hypothetical protein  33.09 
 
 		 294 aa  162  4.0000000000000004e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2218  hypothetical protein  32.62 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.545935 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1895  hypothetical protein  31.9 
 
 		 317 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0457174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2465  hypothetical protein  29.78 
 
 		 279 aa  145  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000153647  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0983  hypothetical protein  31.72 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2120  hypothetical protein  29.28 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.530906  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3499  hypothetical protein  30.91 
 
 		 342 aa  117  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  0.59923 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2066  hypothetical protein  30.53 
 
 		 316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.615053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0007  hypothetical protein  28.62 
 
 		 285 aa  98.6  1e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>