17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0897 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0897  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  155  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000138918  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0841  hypothetical protein  93.33 
 
 
75 aa  147  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.159049  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0200  hypothetical protein  77.03 
 
 
75 aa  124  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.717937 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0281  hypothetical protein  60.61 
 
 
75 aa  91.3  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.804156  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1576  hypothetical protein  54.05 
 
 
77 aa  89.7  1e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119681  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4620  hypothetical protein  41.27 
 
 
74 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1114  hypothetical protein  47.46 
 
 
77 aa  61.6  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.604065 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0527  hypothetical protein  49.15 
 
 
73 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1398  hypothetical protein  45.76 
 
 
73 aa  58.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.93105 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2629  hypothetical protein  44.07 
 
 
74 aa  57.8  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3573  hypothetical protein  41.27 
 
 
78 aa  57  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0399  hypothetical protein  45.76 
 
 
73 aa  55.1  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02183  hypothetical protein  46.67 
 
 
55 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.85763  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2785  hypothetical protein  51.28 
 
 
125 aa  43.5  0.0009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.253251  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0222  hypothetical protein  37.29 
 
 
70 aa  41.2  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1179  hypothetical protein  31.51 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.750426  normal  0.880365 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0222  hypothetical protein  35.59 
 
 
70 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>