49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3883 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_4003  hypothetical protein  50 
 
 		 784 aa  677    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5117  protein of unknown function DUF1631  49.63 
 
 		 804 aa  681    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3353  hypothetical protein  49.3 
 
 		 784 aa  675    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.739095  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4085  hypothetical protein  48.73 
 
 		 784 aa  668    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0688006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3883  hypothetical protein  100 
 
 		 780 aa  1580    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.428838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4642  hypothetical protein  47.87 
 
 		 795 aa  654    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4643  hypothetical protein  74.9 
 
 		 810 aa  782    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.43497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3864  hypothetical protein  52.34 
 
 		 790 aa  756    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0836  hypothetical protein  43.98 
 
 		 801 aa  592  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0279  hypothetical protein  44.88 
 
 		 773 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0968275 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0346  hypothetical protein  49.81 
 
 		 850 aa  479  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198379 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2129  hypothetical protein  25.6 
 
 		 744 aa  109  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.796066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0429  hypothetical protein  25.97 
 
 		 727 aa  98.6  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.9239 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4133  hypothetical protein  28.98 
 
 		 687 aa  97.1  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0847  hypothetical protein  29.32 
 
 		 890 aa  95.5  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2114  hypothetical protein  24.66 
 
 		 787 aa  94.4  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190473  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0949  hypothetical protein  22.04 
 
 		 751 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2314  hypothetical protein  24.18 
 
 		 735 aa  88.6  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1247  hypothetical protein  25.3 
 
 		 782 aa  87.8  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0779  hypothetical protein  28.06 
 
 		 766 aa  87.4  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0751  hypothetical protein  26.95 
 
 		 763 aa  86.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.567279 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0786  hypothetical protein  27.01 
 
 		 729 aa  84.7  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341709 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0764  hypothetical protein  21.8 
 
 		 781 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0953  hypothetical protein  25.45 
 
 		 766 aa  76.3  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596872  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0816  hypothetical protein  24.44 
 
 		 751 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2241  hypothetical protein  26.25 
 
 		 782 aa  73.9  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0875  hypothetical protein  24.15 
 
 		 842 aa  73.6  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0738842 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0820  cell division protein FtsZ  22.69 
 
 		 764 aa  73.9  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0125442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58690  hypothetical protein  25 
 
 		 751 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.544037 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5140  hypothetical protein  24.29 
 
 		 749 aa  71.2  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1435  hypothetical protein  22.79 
 
 		 771 aa  68.9  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2170  hypothetical protein  22.89 
 
 		 737 aa  68.2  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4760  hypothetical protein  24.29 
 
 		 447 aa  63.2  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22061  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0822  hypothetical protein  24.9 
 
 		 719 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4406  hypothetical protein  24.79 
 
 		 721 aa  61.6  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117254  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3053  hypothetical protein  22.79 
 
 		 732 aa  60.1  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0788  hypothetical protein  23.14 
 
 		 745 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0811  hypothetical protein  23.14 
 
 		 717 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.083655  normal  0.106889 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4528  hypothetical protein  21.77 
 
 		 854 aa  53.9  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02373  hypothetical protein  25.54 
 
 		 802 aa  53.5  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2151  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25 
 
 		 1072 aa  51.6  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.439713  normal  0.242332 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0969  hypothetical protein  22.63 
 
 		 445 aa  49.7  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.852631  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2607  hypothetical protein  21.56 
 
 		 741 aa  49.7  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.978979  normal  0.181183 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3555  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  20.48 
 
 		 1249 aa  49.7  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2904  hypothetical protein  24.01 
 
 		 867 aa  48.9  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1201  hypothetical protein  21.81 
 
 		 742 aa  48.1  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0848  hypothetical protein  32.39 
 
 		 824 aa  45.8  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0761  hypothetical protein  32.39 
 
 		 828 aa  45.8  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0851  hypothetical protein  21.26 
 
 		 445 aa  46.2  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.509842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>