20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_R0049 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_R0049  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.193583  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0035  tRNA-Val  90.62 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0045  tRNA-Val  88.41 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00029215  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0042  tRNA-Val  92 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000949792  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0003  tRNA-Val  94.59 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000579556  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14031  tRNA-Val  92.31 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000460426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0021  tRNA-Val  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0018  tRNA-Val  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0243467  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0041  tRNA-Val  100 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.424139  normal  0.210105 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0017  tRNA-Val  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.217131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0017  tRNA-Val  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0043  tRNA-Val  90.24 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0298498  normal  0.206957 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0050  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.651338  normal  0.744651 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0050  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.568856  normal  0.757396 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0043  tRNA-Val  83.82 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000000282186  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0046  tRNA-Val  83.82 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000910848  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0035  tRNA-Val  84.21 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000297756  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0024  tRNA-Val  93.75 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.198375  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10340  tRNA-Val  82.67 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0379292 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0041  tRNA-Val  86 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>