54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0764 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0764  hypothetical protein  100 
 
 		 781 aa  1594    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0820  cell division protein FtsZ  29.4 
 
 		 764 aa  292  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0125442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58690  hypothetical protein  31.65 
 
 		 751 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.544037 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5140  hypothetical protein  31.96 
 
 		 749 aa  281  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0779  hypothetical protein  29.28 
 
 		 766 aa  273  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2114  hypothetical protein  28.63 
 
 		 787 aa  265  4e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190473  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0949  hypothetical protein  29.39 
 
 		 751 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0816  hypothetical protein  29.84 
 
 		 751 aa  259  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0786  hypothetical protein  29.51 
 
 		 729 aa  253  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341709 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2314  hypothetical protein  28.83 
 
 		 735 aa  241  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0875  hypothetical protein  29.94 
 
 		 842 aa  240  6.999999999999999e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0738842 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0953  hypothetical protein  27.96 
 
 		 766 aa  234  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596872  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0751  hypothetical protein  26.15 
 
 		 763 aa  226  1e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.567279 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0699  protein of unknown function DUF1631  27.89 
 
 		 773 aa  224  6e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.268383  normal  0.290029 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0822  hypothetical protein  30.34 
 
 		 719 aa  220  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0788  hypothetical protein  30 
 
 		 745 aa  217  8e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0811  hypothetical protein  29.76 
 
 		 717 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.083655  normal  0.106889 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4406  hypothetical protein  30.45 
 
 		 721 aa  195  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117254  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3053  hypothetical protein  28.11 
 
 		 732 aa  192  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02373  hypothetical protein  32.94 
 
 		 802 aa  182  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04577  hypothetical protein  33.07 
 
 		 763 aa  172  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2129  hypothetical protein  24.74 
 
 		 744 aa  171  6e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.796066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3274  protein of unknown function DUF1631  26.26 
 
 		 760 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2241  hypothetical protein  29.71 
 
 		 782 aa  162  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2229  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1201 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.186545  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3555  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.51 
 
 		 1249 aa  147  9e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0761  hypothetical protein  29.37 
 
 		 828 aa  141  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0848  hypothetical protein  29.62 
 
 		 824 aa  138  4e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1435  hypothetical protein  24.66 
 
 		 771 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0969  hypothetical protein  26.68 
 
 		 445 aa  107  8e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.852631  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0851  hypothetical protein  25.73 
 
 		 445 aa  103  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.509842  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4133  hypothetical protein  24.35 
 
 		 687 aa  94.7  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4085  hypothetical protein  23.69 
 
 		 784 aa  88.6  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0688006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4642  hypothetical protein  26.4 
 
 		 795 aa  88.6  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3864  hypothetical protein  23.64 
 
 		 790 aa  88.6  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3353  hypothetical protein  26.57 
 
 		 784 aa  83.6  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.739095  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4003  hypothetical protein  26.57 
 
 		 784 aa  83.2  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0847  hypothetical protein  26.92 
 
 		 890 aa  80.9  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3883  hypothetical protein  21.46 
 
 		 780 aa  79.3  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.428838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2151  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.34 
 
 		 1072 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.439713  normal  0.242332 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4760  hypothetical protein  26.53 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22061  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0836  hypothetical protein  24.23 
 
 		 801 aa  67.8  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1247  hypothetical protein  22.35 
 
 		 782 aa  67  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0346  hypothetical protein  22.2 
 
 		 850 aa  66.2  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198379 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2088  hypothetical protein  27.01 
 
 		 524 aa  64.7  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.721008 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2036  hypothetical protein  26.1 
 
 		 473 aa  64.3  0.000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4643  hypothetical protein  22.41 
 
 		 810 aa  63.5  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.43497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0279  hypothetical protein  24.31 
 
 		 773 aa  62.8  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0968275 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5117  protein of unknown function DUF1631  24.44 
 
 		 804 aa  62.4  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0429  hypothetical protein  22.76 
 
 		 727 aa  60.8  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.9239 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2607  hypothetical protein  24.32 
 
 		 741 aa  59.7  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.978979  normal  0.181183 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1201  hypothetical protein  24.32 
 
 		 742 aa  58.9  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0773  hypothetical protein  23.98 
 
 		 724 aa  47.4  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.639305  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4528  hypothetical protein  22.59 
 
 		 854 aa  45.4  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134152  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>