16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3430 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3430  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  231  4.0000000000000004e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.692072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4185  hypothetical protein  79.51 
 
 		 123 aa  166  9e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.295357  normal  0.923646 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1250  hypothetical protein  81.48 
 
 		 119 aa  144  6e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1392  hypothetical protein  75 
 
 		 123 aa  142  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2359  hypothetical protein  77.98 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686199  unclonable  0.000000113838 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1178  hypothetical protein  72.95 
 
 		 119 aa  136  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2865  hypothetical protein  52.78 
 
 		 114 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2400  hypothetical protein  61.11 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2180  hypothetical protein  60.19 
 
 		 117 aa  105  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0689  hypothetical protein  52.29 
 
 		 117 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.293413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1619  hypothetical protein  58.18 
 
 		 116 aa  103  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0429  hypothetical protein  51.38 
 
 		 116 aa  92.8  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.697618  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0942  hypothetical protein  58.33 
 
 		 117 aa  87.4  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0487  hypothetical protein  44.71 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36370  hypothetical protein  39.18 
 
 		 118 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.375458  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1427  hypothetical protein  28.57 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.273174  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>