14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2345 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2345  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  587  1e-166  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.129734  normal  0.0203272 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3122  hypothetical protein  92.91 
 
 		 284 aa  549  1e-155  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0971  hypothetical protein  54.51 
 
 		 277 aa  325  6e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2546  hypothetical protein  53.62 
 
 		 277 aa  321  7e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1402  hypothetical protein  38.11 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.201679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0680  hypothetical protein  31.16 
 
 		 294 aa  158  1e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2465  hypothetical protein  33.81 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000153647  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2218  hypothetical protein  30.47 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.545935 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1895  hypothetical protein  30.47 
 
 		 317 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0457174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3499  hypothetical protein  28.18 
 
 		 342 aa  122  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  0.59923 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2120  hypothetical protein  27.76 
 
 		 309 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.530906  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0983  hypothetical protein  27.24 
 
 		 315 aa  102  7e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0007  hypothetical protein  27.37 
 
 		 285 aa  97.4  2e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2066  hypothetical protein  27.24 
 
 		 316 aa  93.6  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.615053  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>