29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2304 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2304  sulfotransferase  100 
 
 
308 aa  642    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.864623  normal  0.10354 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1825  sulfotransferase  63.85 
 
 
302 aa  421  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.497043 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0082  sulfotransferase  64.07 
 
 
300 aa  420  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5094  sulfotransferase  52.44 
 
 
317 aa  328  7e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04340  sulfotransferase  46.03 
 
 
310 aa  288  8e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7152  sulfotransferase  44.07 
 
 
312 aa  287  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2372  sulfotransferase  42.18 
 
 
319 aa  224  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2110  sulfotransferase  32.67 
 
 
297 aa  179  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16705  normal  0.845764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6174  sulfotransferase  37.68 
 
 
296 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11402  glycolipid sulfotransferase  33.09 
 
 
326 aa  152  8e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0484  sulfotransferase  31.51 
 
 
314 aa  97.1  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.948459  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2745  sulfotransferase  29.59 
 
 
314 aa  93.2  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.486823  hitchhiker  0.00314682 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4186  sulfotransferase  29.77 
 
 
324 aa  92.4  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.593585  normal  0.326163 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2217  Alcohol sulfotransferase  26.74 
 
 
287 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.116061 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2155  Alcohol sulfotransferase  26.74 
 
 
272 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1291  sulfotransferase  25.1 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0085  sulfotransferase  24.64 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.139736 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_35253  predicted protein  27.68 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0517  sulfotransferase  25.62 
 
 
274 aa  64.7  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.485393  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0274  sulfotransferase  26.48 
 
 
325 aa  60.1  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.38672  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32551  predicted protein  26.97 
 
 
304 aa  59.3  0.00000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.899642  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0935  sulfotransferase  24.81 
 
 
279 aa  55.8  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.016452 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1549  sulfotransferase  24.4 
 
 
258 aa  55.8  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0854  sulfotransferase  22.46 
 
 
299 aa  53.5  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2689  sulfotransferase  22.5 
 
 
281 aa  50.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.184412 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0057  sulfotransferase  23.36 
 
 
278 aa  50.1  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4140  sulfotransferase  21.79 
 
 
243 aa  49.7  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.888871 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1283  sulfotransferase  21.25 
 
 
293 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0779  sulfotransferase  21.62 
 
 
258 aa  43.1  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>