47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2263 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2263  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  218  1.9999999999999999e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4162  hypothetical protein  67.09 
 
 		 92 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.186646 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3873  hypothetical protein  58.7 
 
 		 92 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0389052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1766  hypothetical protein  65.82 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1414  hypothetical protein  65.82 
 
 		 88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0680005  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2648  hypothetical protein  70.13 
 
 		 80 aa  110  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.250231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3096  hypothetical protein  63.29 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4841  protein of unknown function DUF526  64.56 
 
 		 92 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0233  hypothetical protein  65 
 
 		 82 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1581  hypothetical protein  65 
 
 		 82 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00359975  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2505  hypothetical protein  60.76 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.460066 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0621  hypothetical protein  63.29 
 
 		 87 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3332  hypothetical protein  64.94 
 
 		 79 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.296234  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0261  hypothetical protein  64.94 
 
 		 82 aa  101  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.783765 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3020  protein of unknown function DUF526  67.09 
 
 		 86 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1640  hypothetical protein  64.56 
 
 		 106 aa  100  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2757  protein of unknown function DUF526  67.09 
 
 		 86 aa  100  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1476  hypothetical protein  63.29 
 
 		 106 aa  99.8  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0240368  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1526  hypothetical protein  63.29 
 
 		 106 aa  99.8  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3170  hypothetical protein  62.07 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142046  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4026  protein of unknown function DUF526  52.75 
 
 		 93 aa  96.7  8e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.180444  normal  0.460906 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2149  hypothetical protein  51.43 
 
 		 102 aa  96.7  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4065  protein of unknown function DUF526  57.89 
 
 		 93 aa  95.1  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3771  hypothetical protein  57.89 
 
 		 93 aa  94  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3536  hypothetical protein  52.81 
 
 		 91 aa  93.2  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.764838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1375  protein of unknown function DUF526  46.88 
 
 		 96 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308026  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2251  hypothetical protein  48.48 
 
 		 96 aa  90.1  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.801472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0853  hypothetical protein  42.72 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4948  hypothetical protein  53.42 
 
 		 94 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.889907  hitchhiker  0.000000138953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2547  hypothetical protein  51.4 
 
 		 108 aa  83.6  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2214  hypothetical protein  54.55 
 
 		 84 aa  83.6  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.309689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1136  protein of unknown function DUF526  54.67 
 
 		 88 aa  82  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059241 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0762  hypothetical protein  45.83 
 
 		 107 aa  81.3  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.468252 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0993  hypothetical protein  43.53 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0435364  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4470  hypothetical protein  47.56 
 
 		 86 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.633615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1095  protein of unknown function DUF526  35 
 
 		 107 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.181448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0040  hypothetical protein  46.05 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.180106  normal  0.479768 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0427  hypothetical protein  40 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2667  hypothetical protein  45 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149229  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3279  hypothetical protein  45.95 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0675  hypothetical protein  39.06 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03656  hypothetical protein  40.91 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.854851  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0151  protein of unknown function DUF526  36.71 
 
 		 84 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0524  hypothetical protein  36.11 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.220211  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3160  hypothetical protein  30.67 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0552174  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0641  hypothetical protein  36.76 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0625  hypothetical protein  36.76 
 
 		 84 aa  40.4  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>