33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1704 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1704  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  606  9.999999999999999e-173  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.624159  normal  0.112956 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1938  hypothetical protein  33.77 
 
 		 287 aa  119  3.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.208921  normal  0.0147778 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0407  hypothetical protein  29.76 
 
 		 289 aa  105  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1857  hypothetical protein  29.74 
 
 		 273 aa  102  7e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.746248 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0503  hypothetical protein  29.32 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3585  hypothetical protein  30.38 
 
 		 258 aa  99  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0908002 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4907  hypothetical protein  26.35 
 
 		 298 aa  97.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.904735  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0544  hypothetical protein  29.82 
 
 		 333 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.520266 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3878  hypothetical protein  28.63 
 
 		 260 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0512827 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0282  hypothetical protein  26.21 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.108801 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2639  hypothetical protein  28.17 
 
 		 292 aa  93.6  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0493  hypothetical protein  25.69 
 
 		 290 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500337  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2555  putative signal peptide protein  28.32 
 
 		 258 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.709242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4587  hypothetical protein  28.94 
 
 		 280 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0428092  normal  0.0490486 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4859  hypothetical protein  25.62 
 
 		 298 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4396  hypothetical protein  25.62 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.558315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0547  hypothetical protein  25 
 
 		 296 aa  87.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0653377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4517  hypothetical protein  26.03 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0243839  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0172  hypothetical protein  27.87 
 
 		 275 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3592  hypothetical protein  27.3 
 
 		 288 aa  86.3  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.456108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3702  hypothetical protein  24.68 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.317768 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0919  hypothetical protein  24.62 
 
 		 276 aa  85.5  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.40379  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4040  hypothetical protein  29.76 
 
 		 263 aa  85.1  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7547  hypothetical protein  25.21 
 
 		 258 aa  84.3  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2291  hypothetical protein  28.95 
 
 		 259 aa  82  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.429146  normal  0.89015 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3666  hypothetical protein  26.25 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000879372 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1940  hypothetical protein  24.32 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2016  hypothetical protein  24.32 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.915492  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3078  hypothetical protein  25.45 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.186835  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0005  hypothetical protein  25.95 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.868942  normal  0.680272 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2581  hypothetical protein  25.11 
 
 		 266 aa  46.6  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132118  hitchhiker  0.00012432 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2014  hypothetical protein  27.27 
 
 		 237 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18999  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0724  hypothetical protein  27.27 
 
 		 237 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.188626  normal  0.512508 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>