10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0060 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0060  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  141  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.517772 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2300  hypothetical protein  71.43 
 
 		 50 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.78628  normal  0.0803488 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3331  hypothetical protein  65.38 
 
 		 52 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.449636  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2168  hypothetical protein  52.78 
 
 		 50 aa  47.8  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3236  hypothetical protein  79.41 
 
 		 53 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5990  hypothetical protein  71.15 
 
 		 52 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4156  hypothetical protein  58.06 
 
 		 51 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2140  hypothetical protein  57.69 
 
 		 52 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.635933  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2127  hypothetical protein  57.69 
 
 		 52 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.071292  normal  0.529379 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2051  hypothetical protein  72.73 
 
 		 52 aa  40.8  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>