8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1894 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1894  30S ribosomal protein S27ae  100 
 
 		 67 aa  140  5e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0307  30S ribosomal protein S27ae  85.07 
 
 		 65 aa  122  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1198  30S ribosomal protein S27ae  85.07 
 
 		 63 aa  120  6e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.591289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1439  30S ribosomal protein S27ae  92.45 
 
 		 65 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.143356  normal  0.0246372 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0594  ribosomal protein S27a  70 
 
 		 72 aa  90.9  5e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0449  ribosomal protein S27a  51.92 
 
 		 53 aa  71.2  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2223  SSU ribosomal protein S27AE  48.98 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000310911 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1409  Ribosomal protein S27a  52.17 
 
 		 63 aa  57.8  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>