18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1845 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1845  paREP10  100 
 
 
55 aa  110  8.000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0876357 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1275  paREP10  85 
 
 
55 aa  74.3  0.0000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00000837585  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0601  hypothetical protein  85 
 
 
56 aa  73.6  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1162  paREP10  87.18 
 
 
62 aa  72.4  0.000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000216847 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0562  paREP10  62.26 
 
 
57 aa  70.5  0.000000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0121  paREP10  64.15 
 
 
57 aa  70.5  0.000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1208  paREP10  72.09 
 
 
57 aa  70.1  0.000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.616973 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0418  paREP10  60.42 
 
 
52 aa  65.5  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2041  hypothetical protein  67.39 
 
 
62 aa  64.3  0.0000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1946  paREP10  66.67 
 
 
53 aa  64.3  0.0000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.321574  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2303  paREP10  61.7 
 
 
50 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0116665 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0720  paREP10  58.33 
 
 
55 aa  62  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2087  hypothetical protein  54.55 
 
 
99 aa  61.2  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.195493 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1970  hypothetical protein  62.26 
 
 
57 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0606  paREP10  56.25 
 
 
54 aa  53.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0613  paREP10  54.17 
 
 
56 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.478802  normal  0.696889 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1575  paREP10  51.06 
 
 
54 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0811  paREP10  44.68 
 
 
55 aa  46.2  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>