13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1683 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1683    100 
 
 
219 bp  434  1e-120  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0355452 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1059  transposase, IS605 OrfB  79.63 
 
 
480 bp  79.8  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1840  transposase, IS605 OrfB  83.33 
 
 
1260 bp  75.8  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.113531  hitchhiker  0.00220366 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0005  transposase, IS605 OrfB  91.3 
 
 
1281 bp  60  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.741123  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0122    81.03 
 
 
4039 bp  56  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.44906  normal  0.010671 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0124  transposase IS605 OrfB  81.03 
 
 
1254 bp  56  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00276741 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1064  transposase, IS605 OrfB  82.76 
 
 
1458 bp  54  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1390  transposase, IS605 OrfB  94.29 
 
 
1383 bp  54  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0644  transposase, IS605 OrfB  86.79 
 
 
1263 bp  50.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0667565  hitchhiker  0.00187927 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1065  transposase, IS605 OrfB  100 
 
 
426 bp  50.1  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0333  transposase, IS605 OrfB  88.64 
 
 
1257 bp  48.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.107927  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1731  transposase, IS605 OrfB  90 
 
 
981 bp  48.1  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0112  paREP12  96.3 
 
 
249 bp  46.1  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.210379  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>