19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1613 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1613  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  100 
 
 		 65 aa  130  3.9999999999999996e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.877119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0638  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  84.62 
 
 		 54 aa  96.7  8e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0536  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  75 
 
 		 58 aa  91.3  4e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0668  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  78.43 
 
 		 60 aa  89  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1956  CopG family transcriptional regulator  59.26 
 
 		 68 aa  65.9  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0796  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  60.87 
 
 		 87 aa  61.2  0.000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0399  CopG family transcriptional regulator  63.04 
 
 		 76 aa  61.2  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.347703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1563  CopG family transcriptional regulator  63.04 
 
 		 76 aa  60.8  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.156874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0593  CopG family transcriptional regulator  60.42 
 
 		 76 aa  60.8  0.000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0102  CopG family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.433684  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2824  putative transcriptional regulator, CopG family  41.46 
 
 		 59 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0168  putative transcriptional regulator, CopG family  42.5 
 
 		 62 aa  43.9  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0524  putative transcriptional regulator, CopG family  36.59 
 
 		 59 aa  43.5  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221557  normal  0.567376 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2407  putative transcriptional regulator, CopG family  40 
 
 		 62 aa  42.7  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0981  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  39.02 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0146172  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1400  putative transcriptional regulators, CopG/Arc/MetJ family  42.86 
 
 		 50 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.562472  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2152  putative transcriptional regulator, CopG family  43.59 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.766946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2232  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 48 aa  41.6  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000030214 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1473  CopG family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 85 aa  41.2  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.297007  normal  0.896918 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>