16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0240 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0240  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  605  9.999999999999999e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0074  hypothetical protein  28.67 
 
 		 309 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000070418  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3495  hypothetical protein  27.47 
 
 		 276 aa  102  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0798  hypothetical protein  26.62 
 
 		 307 aa  87.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2563  hypothetical protein  33.95 
 
 		 304 aa  86.3  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1885  hypothetical protein  28.1 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911612 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08196  hypothetical protein  26.46 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.00000170796  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0056  hypothetical protein  25.09 
 
 		 287 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000186467 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02980  hypothetical protein  25.23 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0653  hypothetical protein  27.39 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.395081  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0261  hypothetical protein  23.84 
 
 		 303 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205526  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2315  hypothetical protein  23.66 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  hitchhiker  0.000000000000558489 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1649  hypothetical protein  34.34 
 
 		 274 aa  46.2  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.432038  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4716  hypothetical protein  25.85 
 
 		 321 aa  45.8  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.428888  normal  0.0726517 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2823  hypothetical protein  25.88 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0963  hypothetical protein  24.88 
 
 		 365 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.369617  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>