20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5396 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5396  colicin immunity protein/pyocin immunity protein  100 
 
 		 85 aa  173  6e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576115  hitchhiker  0.00133888 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0165  colicin/pyocin immunity family protein  59.04 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5395  colicin immunity protein/pyocin immunity protein  54.32 
 
 		 86 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.634408  hitchhiker  0.00565903 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4047  colicin immunity protein/pyocin immunity protein  48.81 
 
 		 85 aa  86.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0497  colicin-E7 immunity protein  48.81 
 
 		 85 aa  86.7  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.127855  hitchhiker  0.00059391 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00542  hypothetical protein  47.62 
 
 		 85 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4762  colicin immunity protein/pyocin immunity protein  46.91 
 
 		 84 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0534582 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0309  colicin immunity protein/pyocin immunity protein  44.58 
 
 		 90 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5233  colicin/pyocin immunity family protein  40.96 
 
 		 90 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5448  colicin/pyocin immunity family protein  40.7 
 
 		 91 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.501372  normal  0.021429 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3287  colicin-E7 immunity protein  39.76 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.918498  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4652  colicin immunity protein/pyocin immunity protein  39.76 
 
 		 91 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0117  putative colicin immunity protein  38.46 
 
 		 94 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.301889 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4420  colicin immunity protein/pyocin immunity protein  35.29 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.284485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1305  Pyocin S-type immunity protein, putative  35.29 
 
 		 87 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4760  colicin immunity protein/pyocin immunity protein  33.75 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0119  putative colicin immunity protein  36.78 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.385833 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0121  putative colicin immunity protein  36.14 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.974645  normal  0.573475 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4544  colicin immunity protein/pyocin immunity protein  36.25 
 
 		 85 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5377  S-type pyocin domain-containing protein  30.12 
 
 		 505 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.496303 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>