49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5383 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5383  SdiA-regulated  100 
 
 		 305 aa  625  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.02449 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5204  SdiA-regulated domain-containing protein  71.76 
 
 		 300 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0314  SdiA-regulated domain-containing protein  70.3 
 
 		 303 aa  437  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183725 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5151  SdiA-regulated domain protein  75.18 
 
 		 300 aa  435  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.965879  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5058  SdiA-regulated domain-containing protein  72.28 
 
 		 300 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0993064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04270  putative transcriptional regulator  65.14 
 
 		 321 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.510674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0418  hypothetical protein  64.08 
 
 		 321 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4848  SdiA-regulated  63.91 
 
 		 317 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5290  hypothetical protein  63.25 
 
 		 312 aa  371  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.842454  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4227  SdiA-regulated domain-containing protein  56.91 
 
 		 303 aa  348  7e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22840  SdiA-regulated domain-containing protein  60.14 
 
 		 308 aa  335  7.999999999999999e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0239521  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38420  hypothetical protein  50.71 
 
 		 309 aa  271  9e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224716 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3272  SdiA-regulated protein  49.65 
 
 		 325 aa  267  2e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4229  SdiA-regulated domain-containing protein  45.03 
 
 		 317 aa  230  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0412  putatitve transcriptional regulator  40.94 
 
 		 310 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5291  hypothetical protein  44.19 
 
 		 310 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04160  putatitve transcriptional regulator  40.88 
 
 		 329 aa  208  9e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4849  SdiA-regulated  40.96 
 
 		 314 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48290  hypothetical protein  42.35 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5205  SdiA-regulated domain-containing protein  37.7 
 
 		 305 aa  193  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.520929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0313  SdiA-regulated domain-containing protein  41.41 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.124016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5152  SdiA-regulated domain protein  38.44 
 
 		 306 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.767361 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5059  SdiA-regulated domain-containing protein  37.91 
 
 		 306 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07110  hypothetical protein  40.57 
 
 		 317 aa  186  5e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187526  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5384  SdiA-regulated  39.22 
 
 		 307 aa  178  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5589  hypothetical protein  36.93 
 
 		 326 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5110  SdiA-regulated  37.59 
 
 		 326 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5845  SdiA-regulated protein  34.14 
 
 		 280 aa  152  5e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.539509 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4878  SdiA-regulated protein  33.46 
 
 		 329 aa  150  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.60346 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4566  hypothetical protein  34.23 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.859711  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4658  hypothetical protein  34.23 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4573  sdiA-regulated family protein  33.85 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4706  SdiA-regulated family protein  33.85 
 
 		 286 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4657  hypothetical protein  33.85 
 
 		 301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4933  hypothetical protein  28.76 
 
 		 323 aa  146  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04202  hypothetical protein  31.89 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04165  hypothetical protein  31.89 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00151161  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4679  hypothetical protein  33.33 
 
 		 282 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3663  SdiA-regulated domain protein  31.89 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000154748  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4588  SrgB  33.33 
 
 		 282 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.537966  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0044  SrgB  33.33 
 
 		 282 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.880775 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4561  hypothetical protein  31.89 
 
 		 323 aa  142  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3731  SdiA-regulated domain-containing protein  31.89 
 
 		 286 aa  142  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00663861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4772  conserved hypothetical protein yjiK  31.89 
 
 		 323 aa  142  9e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2428  hypothetical protein  29.67 
 
 		 302 aa  95.9  8e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0451472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5082  sdiA-regulated domain protein  29.57 
 
 		 272 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.142061 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1215  inner membrane protein  25.79 
 
 		 280 aa  57  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1385  putative extracellular nuclease  23.36 
 
 		 751 aa  53.5  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14292  normal  0.827149 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1201  hypothetical protein  42.65 
 
 		 245 aa  43.1  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.800385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>