61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5109 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5109  S-adenosylmethionine decarboxylase  100 
 
 		 264 aa  546  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0795  S-adenosylmethionine decarboxylase  88.97 
 
 		 264 aa  495  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08390  S-adenosylmethionine decarboxylase  88.97 
 
 		 264 aa  494  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000233299 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0598  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  90.08 
 
 		 264 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4575  S-adenosylmethionine decarboxylase  90.08 
 
 		 264 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46080  S-adenosylmethionine decarboxylase  87.45 
 
 		 264 aa  487  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2078  S-adenosylmethionine decarboxylase  69.32 
 
 		 292 aa  404  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3552  S-adenosylmethionine decarboxylase  69.85 
 
 		 263 aa  404  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2244  S-adenosylmethionine decarboxylase  68.7 
 
 		 273 aa  394  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.868188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0951  S-adenosylmethionine decarboxylase  68.44 
 
 		 276 aa  389  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3483  S-adenosylmethionine decarboxylase  67.43 
 
 		 264 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000055229  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1024  S-adenosylmethionine decarboxylase  67.43 
 
 		 264 aa  386  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3355  S-adenosylmethionine decarboxylase  67.43 
 
 		 264 aa  386  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000217345  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2837  S-adenosylmethionine decarboxylase  68.08 
 
 		 264 aa  386  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0913  S-adenosylmethionine decarboxylase  67.68 
 
 		 264 aa  385  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.365148  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2355  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  66.67 
 
 		 269 aa  385  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00118  hypothetical protein  66.79 
 
 		 264 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000726106  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0127  S-adenosylmethionine decarboxylase  66.79 
 
 		 264 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736728  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3482  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  66.79 
 
 		 264 aa  382  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000023207  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4002  S-adenosylmethionine decarboxylase  67.31 
 
 		 264 aa  382  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0122  S-adenosylmethionine decarboxylase  66.79 
 
 		 264 aa  382  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0933555  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0124  S-adenosylmethionine decarboxylase  66.79 
 
 		 264 aa  382  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000121988  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00119  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  66.79 
 
 		 264 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00015961  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3539  S-adenosylmethionine decarboxylase  66.79 
 
 		 264 aa  382  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00206954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0130  S-adenosylmethionine decarboxylase  66.79 
 
 		 264 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.274606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0113  S-adenosylmethionine decarboxylase  66.79 
 
 		 264 aa  382  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000197451  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3130  S-adenosylmethionine decarboxylase  66.54 
 
 		 264 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1015  S-adenosylmethionine decarboxylase  66.67 
 
 		 264 aa  381  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0184  S-adenosylmethionine decarboxylase  66.67 
 
 		 264 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.877989 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0189  S-adenosylmethionine decarboxylase  67.05 
 
 		 264 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.409769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0181  S-adenosylmethionine decarboxylase  66.67 
 
 		 264 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.515006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0197  S-adenosylmethionine decarboxylase  66.67 
 
 		 264 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.940693  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0180  S-adenosylmethionine decarboxylase  67.43 
 
 		 264 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0668  S-adenosylmethionine decarboxylase  66.79 
 
 		 264 aa  377  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000040658  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2794  S-adenosylmethionine decarboxylase  67.18 
 
 		 271 aa  375  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0123327  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1749  S-adenosylmethionine decarboxylase  67.82 
 
 		 279 aa  376  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.163697  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1235  S-adenosylmethionine decarboxylase  64.21 
 
 		 276 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000212775  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0737  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  63.88 
 
 		 276 aa  365  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000135532  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3714  S-adenosylmethionine decarboxylase  64.09 
 
 		 264 aa  359  2e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0878  S-adenosylmethionine decarboxylase  64.09 
 
 		 264 aa  356  2.9999999999999997e-97  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00026083  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04007  S-adenosylmethionine decarboxylase  63.32 
 
 		 264 aa  355  5.999999999999999e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0791  S-adenosylmethionine decarboxylase  63.71 
 
 		 264 aa  354  1e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0513  S-adenosylmethionine decarboxylase  56.55 
 
 		 271 aa  322  3e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2796  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  55.26 
 
 		 270 aa  321  9.000000000000001e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0527  S-adenosylmethionine decarboxylase  56.18 
 
 		 271 aa  320  1.9999999999999998e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0630  S-adenosylmethionine decarboxylase  45.42 
 
 		 252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1388  S-adenosylmethionine decarboxylase related  30.08 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1085  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  24 
 
 		 129 aa  49.3  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000176984  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3365  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  26.72 
 
 		 125 aa  48.5  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000484703  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2428  S-adenosylmethionine decarboxylase related  26.17 
 
 		 161 aa  47  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0223942  normal  0.174455 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2122  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  26.56 
 
 		 124 aa  46.2  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000043873  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20181  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  30.19 
 
 		 155 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.750537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1144  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  30.19 
 
 		 155 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0715  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  26.77 
 
 		 124 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000012378  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1608  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  26.77 
 
 		 124 aa  44.3  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000721312  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5302  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  23.53 
 
 		 123 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000919231 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1479  adenosylmethionine decarboxylase  25 
 
 		 131 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2192  S-adenosylmethionine decarboxylase related  39.68 
 
 		 154 aa  42.7  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4906  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  23.53 
 
 		 123 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5655  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  26.19 
 
 		 137 aa  42.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.936645  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24630  S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme  28.8 
 
 		 129 aa  42.4  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.768162  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>