34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3015 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3015  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  224  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59860  putative type III effector Hop protein  47.92 
 
 		 119 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114799  hitchhiker  0.000000000000152109 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1634  hypothetical protein  51.58 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3416  hypothetical protein  48.08 
 
 		 127 aa  92.8  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.199537  normal  0.0728248 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3322  hypothetical protein  44.44 
 
 		 111 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.840275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4507  hypothetical protein  46.88 
 
 		 112 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2940  hypothetical protein  43.93 
 
 		 119 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1975  hypothetical protein  51.11 
 
 		 106 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.793487  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2851  plasmid conserved hypothetical protein RAQPRD  47.19 
 
 		 116 aa  87.4  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.410832  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1406  putative secreted protein  43.27 
 
 		 126 aa  87  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0449246  normal  0.883784 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1264  hypothetical protein  44.44 
 
 		 127 aa  87  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2345  hypothetical protein  43.81 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000024781  unclonable  0.000000135076 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1172  plasmid conserved hypothetical protein RAQPRD  43.81 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36200  Plasmid hypothetical protein, RAQPRD  48.45 
 
 		 118 aa  84.7  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0443  hypothetical protein  44.9 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4171  hypothetical protein  40.91 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0787775  normal  0.908625 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2386  hypothetical protein  43.97 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0956  hypothetical protein  42.62 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1192  hypothetical protein  40.78 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0476297  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0869  hypothetical protein  46.08 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1450  hypothetical protein  43.81 
 
 		 120 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176876 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2194  hypothetical protein  45.16 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0675  hypothetical protein  49.32 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0510  hypothetical protein  42.72 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0652  hypothetical protein  35.11 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3713  hypothetical protein  37 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4094  hypothetical protein  38.82 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4177  hypothetical protein  38.82 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0640  hypothetical protein  38.71 
 
 		 100 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0368  hypothetical protein  48.21 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0329  hypothetical protein  37.65 
 
 		 110 aa  53.5  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.132936 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1756  hypothetical protein  33.68 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0682  hypothetical protein  35.11 
 
 		 100 aa  51.6  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2762  hypothetical protein  27 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>