30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1412 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1412  hypothetical protein  100 
 
 		 358 aa  734    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1582  hypothetical protein  77.68 
 
 		 355 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422595  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3903  hypothetical protein  76.27 
 
 		 356 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4572  hypothetical protein  75.63 
 
 		 357 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3872  hypothetical protein  76.19 
 
 		 357 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.286953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4093  hypothetical protein  75.35 
 
 		 357 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1317  hypothetical protein  74.79 
 
 		 357 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3985  hypothetical protein  70.74 
 
 		 361 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.315148  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29120  hypothetical protein  70.45 
 
 		 361 aa  501  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446947 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1789  hypothetical protein  65.35 
 
 		 364 aa  488  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.651057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1600  hypothetical protein  41.95 
 
 		 357 aa  276  4e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.867208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3749  hypothetical protein  40.12 
 
 		 379 aa  251  1e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4190  hypothetical protein  35.91 
 
 		 395 aa  218  1e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03982  hypothetical protein  30.97 
 
 		 369 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.47471  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12788  hypothetical protein  31.27 
 
 		 401 aa  189  5e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.405764  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5355  hypothetical protein  32.28 
 
 		 393 aa  187  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2262  hypothetical protein  30.65 
 
 		 413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.279668  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4139  hypothetical protein  28.69 
 
 		 376 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0375  hypothetical protein  27.81 
 
 		 382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0193  hypothetical protein  24.8 
 
 		 397 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0142  hypothetical protein  32.07 
 
 		 541 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0125  hypothetical protein  32.24 
 
 		 541 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1873  hypothetical protein  22.99 
 
 		 385 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146136  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1794  hypothetical protein  22.99 
 
 		 385 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400536  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2083  hypothetical protein  22.13 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.213207  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1745  hypothetical protein  21.47 
 
 		 384 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.886322  normal  0.285515 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2712  hypothetical protein  25.52 
 
 		 595 aa  58.9  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0896  putative transmembrane protein  19.81 
 
 		 1261 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0198015  normal  0.329843 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0857  hypothetical protein  21.95 
 
 		 968 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.218657  normal  0.239267 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1259  hypothetical protein  21.38 
 
 		 996 aa  43.1  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>