16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1319 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1319  hypothetical protein  100 
 
 		 228 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1320  hypothetical protein  41.52 
 
 		 239 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4794  hypothetical protein  39.23 
 
 		 282 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0699794 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2516  hypothetical protein  33.18 
 
 		 260 aa  119  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0491  hypothetical protein  33.49 
 
 		 247 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4104  hypothetical protein  33.33 
 
 		 262 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1872  hypothetical protein  30.29 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3528  hypothetical protein  39.15 
 
 		 281 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.113954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4249  hypothetical protein  37.96 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4117  hypothetical protein  37.96 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4011  hypothetical protein  37.26 
 
 		 272 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal  0.540856 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1919  hypothetical protein  35.81 
 
 		 274 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16340  hypothetical protein  32.23 
 
 		 267 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1406  hypothetical protein  33.02 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00692246  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00381  hypothetical protein  33.17 
 
 		 267 aa  60.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.90703  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2832  hypothetical protein  29.33 
 
 		 313 aa  47  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.731194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>